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免疫共沉淀(Co-IP)
作者:互聯(lián)網(wǎng)    日期:2019-04-15

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CoIP)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法,用于確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用。


其原理是:當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時,完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。如果用蛋白質(zhì)x的抗體免疫沉淀x,那么與x在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)y也能沉淀下來。目前多用精制的prorein A預(yù)先結(jié)合固化在argarose的beads上,使之與含有抗原的溶液及抗體反應(yīng)后,beads上的prorein A就能吸附抗原達(dá)到精制的目的。這種方法常用于測定兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合;也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。


一、免疫共沉淀的優(yōu)點
 
1.  相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的,處于天然狀態(tài)。
2.  蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的,可以避免人為的影響。
3.  可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物。
二、免疫共沉淀的缺點
 
1.  可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用;
2.  兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合,而可能有第三者在中間起橋梁作用;
3.  必須在實驗前預(yù)測目的蛋白是什么,以選擇最后檢測的抗體,所以,若預(yù)測不正確,實驗就得不到結(jié)果,方法本身具有冒險性。
一、試劑準(zhǔn)備
 1.  預(yù)冷PBS,RIPA Buffer,細(xì)胞刮子(用保鮮膜包好后,埋冰下),離心機。
 2.  用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞兩次,最后一次吸干PBS。
3.  加入預(yù)冷的RIPA Buffer(1 ml/107個細(xì)胞、10 cm培養(yǎng)皿或150 cm2培養(yǎng)瓶,0.5 ml/5x106個細(xì)胞、6 cm培養(yǎng)皿、75 cm2培養(yǎng)瓶)。
 4.  用預(yù)冷的細(xì)胞刮子將細(xì)胞從培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶上刮下,把懸液轉(zhuǎn)到1.5EP管中,4℃,緩慢晃動15 min(EP管插冰上,置水平搖床上)。
 5.  4℃,14000 g離心15 min,立即將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中。
 6.  準(zhǔn)備Protein A agarose,用PBS 洗兩遍珠子,然后用PBS配制成50%濃度,建議減掉槍尖部分,避免在涉及瓊脂糖珠的操作中破壞瓊脂糖珠。
 7.   每1 ml總蛋白中加入100 ul Protein A瓊脂糖珠(50%),4℃搖晃10 min(EP管插冰上,置水平搖床上),以去除非特異性雜蛋白,降低背景。
 8.   4℃,14000 g離心1 5min,將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中,去除Protein A珠子。
 9. (Bradford 法)做蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線,測定蛋白濃度,測前將總蛋白至少稀釋1:10倍以上,以減少細(xì)胞裂解液中去垢劑的影響(定量,分裝后,可以在-20℃保存一個月)。
 10.  用PBS將總蛋白稀釋到約1 ug/ul,以降低裂解液中去垢劑的濃度,如果興趣蛋白在細(xì)胞中含量較低,則總蛋白濃度應(yīng)該稍高(如10 ug/ul)。
 11.  加入一定體積的兔抗到500 ul總蛋白中,抗體的稀釋比例因興趣蛋白在不同細(xì)胞系中的多少而異。
 12.  4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫2h,激酶或磷酸酯酶活性分析建議用2 h室溫孵育。
 13.  加入100 ul Protein A瓊脂糖珠來捕捉抗原抗體復(fù)合物,4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫1 h,如果所用抗體為鼠抗或雞抗,建議加2 ul "過渡抗體"(兔抗鼠IgG,兔抗雞IgG)。
 14.  14000 rpm瞬時離心5 s,收集瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物,去上清,用預(yù)冷的RIPA buffer洗3遍,800 ul/遍,RIPA buffer有時候會破壞瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物內(nèi)部的結(jié)合,可以使用PBS。
 15.  用60 ul 2x上樣緩沖液將瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物懸起,輕輕混勻,緩沖液的量依據(jù)上樣多少的需要而定(60 ul足夠上三道)。
16.  將上樣樣品煮5 min,以游離抗原,抗體,珠子,離心,將上清電泳,收集剩余瓊脂糖珠,上清也可以暫時凍-20℃,留待以后電泳,電泳前應(yīng)再次煮5 min變性。


客戶提供:


1、組織、細(xì)胞、蛋白質(zhì)溶液等樣品、用于免疫共沉淀的一抗及目的蛋白的相關(guān)信息;
2、如需構(gòu)建基因的過表達(dá)載體,則還需提供過表達(dá)載體及其相關(guān)信息;
3、其他與免疫共沉淀相關(guān)信息。


實驗結(jié)果:

1、免疫共沉淀電子圖片及分析結(jié)果
2、相互作用蛋白鑒定結(jié)果,質(zhì)譜鑒定結(jié)果和(或)western blot鑒定結(jié)果;
 3、完整的實驗步驟、使用儀器、軟件檢索參數(shù)等。

合作單位: